Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRKQ15262 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms