Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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ODF1Q14990 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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ODF1Q14990 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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ODF1Q14990 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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ODF1Q14990 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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ODF1Q14990 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ODF1Q14990 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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