Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MDC1Q14676 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms