Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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GBX1Q14549 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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GBX1Q14549 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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