Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms