Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX2Q13950 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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