Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SHROOM2Q13796 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SHROOM2Q13796 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms