Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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