Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms