Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1orf61Q13536 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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