Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBB3Q13509 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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