Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TCIRG1Q13488 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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