Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms