Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NME3Q13232 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NME3Q13232 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NME3Q13232 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NME3Q13232 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NME3Q13232 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NME3Q13232 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NME3Q13232 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NME3Q13232 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NME3Q13232 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NME3Q13232 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NME3Q13232 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NME3Q13232 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NME3Q13232 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NME3Q13232 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NME3Q13232 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
NME3Q13232 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NME3Q13232 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NME3Q13232 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NME3Q13232 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NME3Q13232 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NME3Q13232 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NME3Q13232 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NME3Q13232 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NME3Q13232 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NME3Q13232 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NME3Q13232 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NME3Q13232 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NME3Q13232 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NME3Q13232 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NME3Q13232 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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NME3Q13232 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NME3Q13232 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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