Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF2Q12933 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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TRAF2Q12933 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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TRAF2Q12933 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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TRAF2Q12933 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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TRAF2Q12933 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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TRAF2Q12933 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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TRAF2Q12933 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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TRAF2Q12933 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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TRAF2Q12933 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TRAF2Q12933 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TRAF2Q12933 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TRAF2Q12933 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TRAF2Q12933 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF2Q12933 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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