Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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