Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
STX4Q12846 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
STX4Q12846 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
STX4Q12846 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
STX4Q12846 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
STX4Q12846 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
STX4Q12846 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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STX4Q12846 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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STX4Q12846 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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STX4Q12846 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
STX4Q12846 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STX4Q12846 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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