Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
HMGXB3Q12766 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC35■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC35■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC35■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC35■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
HMGXB3Q12766 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms