Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KCNA1Q09470 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNA1Q09470 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms