Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms