Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARHGAP1Q07960 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms