Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLEQ07864 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLEQ07864 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLEQ07864 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms