Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KDSRQ06136 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms