Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms