Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC25A11Q02978 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A11Q02978 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms