Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLOD1Q02809 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLOD1Q02809 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms