Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSC2Q02487 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSC2Q02487 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms