Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms