Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSG6Q00889 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms