Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms