Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAD3P84022 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms