Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMF1P82094 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMF1P82094 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMF1P82094 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMF1P82094 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMF1P82094 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMF1P82094 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMF1P82094 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMF1P82094 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMF1P82094 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMF1P82094 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMF1P82094 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMF1P82094 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMF1P82094 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms