Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms