Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms