Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP1P63208 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP1P63208 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP1P63208 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP1P63208 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP1P63208 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP1P63208 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP1P63208 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP1P63208 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP1P63208 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKP1P63208 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKP1P63208 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKP1P63208 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKP1P63208 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms