Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP4CP60510 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP4CP60510 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms