Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2BFSP57053 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2BFSP57053 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms