Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms