Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATXN3P54252 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms