Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP2S1P53680 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms