Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF6P49848 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF6P49848 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF6P49848 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms