Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA1P49639 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA1P49639 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms