Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD2P49005 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD2P49005 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD2P49005 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD2P49005 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD2P49005 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD2P49005 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD2P49005 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD2P49005 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD2P49005 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD2P49005 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
POLD2P49005 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms