Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIP4K2AP48426 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms