Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL35P42766 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL35P42766 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL35P42766 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms