Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA2P42765 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACAA2P42765 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms