Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTGDSP41222 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms