Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFHR2P36980 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CFHR2P36980 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms