Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCN1P35523 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN1P35523 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms