Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNB1P35222 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms